Se llevan a cabo proyectos de Gestión de la calidad del aire de las ciudades de Mexicali, Tijuana, y playas de rosarito, conocidos como proaires que implica un estudio de tendencias de los contaminantes de referencia, su efecto en la salud, un inventario de emisiones, el establecimiento de estrategias y metas para llevarlas a cabo. También se estudian las partículas aerobiológicas por su incidencia en las enfermedades infecto-respiratorias

Las actividades inherentes al desarrollo del  Laboratorio de Calidad del Aire están bajo la coordinación del Dr. Margarito Quintero Nuñez y son apoyadas por la Dra. Silvia Ahumada Valdez. A la fecha la información que se maneja para el diagnóstico de la calidad del aire se obtiene de datos de la red de estaciones de monitoreo de calidad del aire que se encuentran en cuatro municipios del estado, con excepción de Ensenada. Varios proyectos se han terminado de manera sobresaliente:

Actualmente se cuenta con cuatro equipos de minivoles y dos equipo de alto volumen  para medir material particulado, PM10 y PM2.5. Asimismo se cuenta con cuatro equipos de Rotorod para medición de pólenes y esporas, que son muy comunes en esta región y se está trabajando para contar con un laboratorio de calidad del aire, que sirva de base a trabajos de investigación y de servicios a la comunidad y a la industria. Las instituciones colaboradoras con las que cuenta son la Universidad Estatal de San Diego, en San Diego y en Valle Imperial y la Universidad de UTAH. Los proyectos son  financiados  por UABC, LASPAU, SCERP, INE y SEMARNAT.

El hecho de que Mexicali está enclavado en una región con altos índices de contaminación tanto a nivel material particulado, como en cuanto a gases (CO, SO2, NOx, O3) se refiere, muestra un gran potencial del desarrollo de los estudios sobre calidad del aire o sobre la contaminación del aire.